El DIF emergió con la nueva estructura académica de la Universidad de Guanajuato en 2008, conformado inicialmente, y hasta a la fecha, con los Cuerpos Académicos (CA) de Mecánica Estadística (CAME) y Física Médica e Instrumentación Biomédica (CAFMIB). Durante los siguientes dos años y medio, el DIF incubó al nuevo Departamento de Ingenierías Química, Electrónica y Biomédica con la contratación, para este nuevo departamento y en dicho periodo,
de 6 profesores de tiempo completo (PTC) y la incorporación de dos profesores que realizaron el cambio del Campus Guanajuato a este Departamento. Desde que se reconoció al nuevo departamento, a mediados del 2011, en el DIF permanecen los 11 profesores de los dos CA’s mencionados anteriormente.